顶尖学术期刊《自然》及其子刊《人造-医学》来日诰日以多篇报道颁发了刚刚实现的人类微生物组整合用意（iHMP）。这是一项历时十多年的大规模研讨，凝聚了举世科学家在多个范畴的伶俐。
▲最新一期《人造》聚焦人类微生物组整合办理（iHMP）（图片起原：Nature）
人类微生物组整合设计（iHMP）由美国国立卫生院自2007年带动。第1阶段的功效曾带给我们良多前所未见的新知：在正常情况下，副本每一个人的身体凡是多样性丰厚的生态情况，种类繁多、数目达上百万亿的微生物与人体共存，而且它们的形成因个体、群体与状况而异。人体微生物组会影响人的健康形状，也在炎症、代谢障碍等疾病形状下遭到干扰。
第2阶段从2013年启动，科学家们踏上新的征途，入手下手采用新的多组学研讨方式探索人体微生物组在疾病过程当中的变动。
▲人类微生物组整合经管（iHMP）分两个阶段。（图片源头：Nature）
这个项目而今带来了适才实现的三项造诣。来自多个研究机构的科学家团队离别索求了三种情况下——炎症性肠病，糖尿病后期，有身和早制作——人体微生物组泛起哪些更换。这些新发明将有助于咱们理解疾病特征，并无望推动疾病治疗。
第一篇论文存眷炎症性肠病，包括克罗恩病和溃疡性结肠炎。这类慢性疾病影响全世界数百万人。炎症性肠病不论是在病例上仍是在免疫学、分子、遗传学、微生物学水准上都尤其冗杂。
美国哈佛大学陈曾熙公家卫生学院的Curtis Huttenhower传授及同事赏析了132名炎症性肠病患者与康健的比拟组被试，在一年工夫里活期采集的粪便、活检和血液样板。研讨人员开辟了一个奇怪的生物技术器械箱，来相识疾病的形状抑郁期时肠道微生物组的组成变更，宿主与微生物组的份子活动转变以及基因抒发的转变。
▲炎症性肠病情况下的宿主-微生物组信息转变示意图（图片来源：Nature）
这项研究为炎症性肠病中的宿主与微生物勾当供应了迄今为止最片面的描述，相关成本、终于与数据梗概经过数据库（http://ibdmdb.org）获取，无望为理解疾病病发与停顿带来深切见地。
第2篇论文关注糖尿病后期。糖尿病也是一种多要素影响的繁冗疾病，在全天下影响人数逾越4亿。糖尿病前期是发生发火2型糖尿病的高风险状态，有70%的前期患者最终会进行成2型糖尿病，但一般未能得到确诊。关注这一初期阶段，有助于尽早检测出2型糖尿病。
斯坦福大学基因组学与个体化医药核心主任Michael Snyder教授率领钻研小组对106名康健天时糖尿病前期个体展开了为期4年的钻研，剖析转录组、代谢组、细胞因子与蛋白质组的更动以及微生物组的改动来提醒分子变卦、遗传更改和微生物变化。他们缔造，像白细胞介素-1受体激动剂（IL-1RA）和超敏C-反应蛋白（CRP）炎症标识表记标帜物与特定的免疫旌旗灯号传导可以或许作为病发前的整体分子特色，提示晚期疾病进行的规律。
另一篇发表在《人造-医学》上的论文描摹了阴道微生物对于早打造风险的影响。
早出产指的是怀胎不够37周胎儿入世。全天下每年有1500万早制作儿，早出产发生率跨越10%。早制作是回生儿死亡的须要启事。
弗吉尼亚联邦大学Gregory Buck教授及同事在1,527名孕妇的整个孕期内开展研讨，经由进程对16S核糖体RNA、宏基因组、元转录组和细胞因子谱的剖析，提示了与早出产风险相关的阴道微生物组变更。比喻，早出产孕妇的卷曲乳杆菌（Lactobacillus crispatus）水准低于足月受孕的妊妇，尚有多种细菌则过量具备。这些发明将有助于为提前预想早出产供应指导。
▲怀孕和早制造情况下阴道微生物组与宿主因子之间的相关示意图（图片来历：Nature）
同期《天然》上还刊发了iHMP项目卖力人、美国国立卫生研讨院的Lita Proctor博士的批驳。瞻望下一个十年，她说：“我认为，只要当我们不再只是去知道微生物的物种称说分类，而末尾理解微生物之间与微生物与宿主之间冗杂多变的生态相关和演化干系，才会促进我们找到治疗糖尿病、癌症和自己免疫疾病的干涉干与法式。”
人类微生物组的后期钻研让咱们在迩来十多年认识到，微生物组是我们重要的“终生一生没世伴侣”。那会，经由进程生态学、微生物学、生物医学、计算机生物学等多学科跨范围的互助，咱们将会更好地相熟若何让咱们和这些一生伴侣坚持良好的相干，彼此照看，一起侥幸。
参考质料
[1] The Integrative Human Microbiome Project. Nature. Doi: 10.1038/s41586-019-1238-8
[2] Jason Lloyd-Price et al., (2019) Multi-omics of the gut microbial ecosystem in inflammatory bowel diseases. Nature. Doi: 10.1038/s41586-019-1237-9
[3] Wenyu Zhou et al., (2019) Longitudinal multi-omics of host–microbe dynamics in prediabetes. Nature. Doi: 10.1038/s41586-019-1236-x
[4]Jennifer M. Fettweis et al., (2019) The vaginal microbiome and preterm birth. Nature Medicine. Doi: 10.1038/s41591-019-0450-2
[5] Lita Pro首席技能官r. (2019) What’s next for the human microbiome? Nature. Doi: 10.1038/d41586-019-01654-0
原标题问题
昨天《天然》封面：十多年跑到新止境，人类微生物组学研究发布三项功效
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